因美納啟動(dòng)與英國(guó)生物樣本庫(kù)及生物制藥合作伙伴的試點(diǎn)蛋白質(zhì)組學(xué)項(xiàng)目
研究將利用Illumina Protein Prep解決方案生成關(guān)鍵參考數(shù)據(jù)集
美國(guó)加利福尼亞州圣迭戈2025年1月14日 /美通社/ -- 全球基因測(cè)序和芯片技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)者因美納(納斯達(dá)克股票代碼:ILMN)宣布與deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、葛蘭素史克、強(qiáng)生和諾華公司合作,啟動(dòng)一項(xiàng)試點(diǎn)蛋白質(zhì)組學(xué)項(xiàng)目,分析來(lái)自英國(guó)生物樣本庫(kù)(UK Biobank, UKB)的5萬(wàn)份樣本。該試點(diǎn)項(xiàng)目基于因美納即將推出的蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)方案Illumina Protein Prep?,由SOMAmer?技術(shù)提供支持,以新一代測(cè)序(NGS)解決方案助力科研界和制藥合作伙伴規(guī)模化獲取蛋白質(zhì)組學(xué)洞見(jiàn)。
蛋白質(zhì)組學(xué)為直接觀測(cè)細(xì)胞功能提供了可能,從而幫助科研工作者深化對(duì)蛋白質(zhì)在健康與疾病中作用的理解,并有助于發(fā)現(xiàn)癌癥和心血管疾病等疾病的生物標(biāo)志物。研究人員使用蛋白質(zhì)數(shù)量性狀位點(diǎn)(pQTLs),這是一種將遺傳變異與蛋白質(zhì)表達(dá)數(shù)據(jù)和疾病或其他表型相聯(lián)系,用于藥物發(fā)現(xiàn)的重要蛋白質(zhì)基因組學(xué)工具。隨著Illumina Protein Prep等高通量蛋白質(zhì)組學(xué)方法的出現(xiàn),新的pQTL的發(fā)現(xiàn)變得更加便捷。
"英國(guó)生物樣本庫(kù)的數(shù)據(jù)已經(jīng)成為組學(xué)領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn)參考數(shù)據(jù)集,在Illumina Protein Prep推出之際,我們很高興能在這一試點(diǎn)研究中與醫(yī)療行業(yè)合作伙伴開展合作," 因美納首席技術(shù)官Steve Barnard博士表示,"我們相信該試點(diǎn)項(xiàng)目將為科研界和制藥合作伙伴提供一套新的高質(zhì)量、基于NGS的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù),以促進(jìn)生物學(xué)洞見(jiàn)的生成。"
英國(guó)生物樣本庫(kù)將提供5萬(wàn)份樣本,這些樣本均來(lái)自已參與英國(guó)生物樣本庫(kù)制藥蛋白組學(xué)項(xiàng)目(UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)的研究對(duì)象,該項(xiàng)目是英國(guó)生物樣本庫(kù)與14家生物制藥公司之間的一項(xiàng)獨(dú)立研究合作。deCODE Genetics將利用Illumina Protein Prep解決方案和NovaSeq? X Plus測(cè)序儀對(duì)樣本進(jìn)行處理,并通過(guò)DRAGEN蛋白定量分析流程進(jìn)行分析。首批3萬(wàn)份樣本的研究由因美納、deCODE Genetics和Standard BioTools, Inc.聯(lián)合投資資助,Tecan作為自動(dòng)化合作伙伴提供相應(yīng)的支持。這些樣本產(chǎn)生的數(shù)據(jù)將在2025年下半年完成質(zhì)量控制后由英國(guó)生物樣本庫(kù)立即提供給科研界。
對(duì)于另外的2萬(wàn)份樣本產(chǎn)生的數(shù)據(jù),根據(jù)英國(guó)生物樣本庫(kù)的標(biāo)準(zhǔn)慣例,行業(yè)聯(lián)盟成員將擁有一段時(shí)間的獨(dú)家訪問(wèn)權(quán)。行業(yè)參與者包括deCODE Genetics及制藥合作伙伴葛蘭素史克、強(qiáng)生和諾華。在此專屬期結(jié)束后,英國(guó)生物樣本庫(kù)將向更廣泛的科研界提供這些數(shù)據(jù)。因美納預(yù)計(jì)將有更多公司加入該聯(lián)盟。
英國(guó)生物樣本庫(kù)首席研究員兼首席執(zhí)行官Rory Collins爵士、教授表示:"這些日益豐富的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)將幫助研究人員描繪出一幅更加動(dòng)態(tài)的圖景,呈現(xiàn)個(gè)體遺傳、環(huán)境和生活方式如何共同影響不同疾病的發(fā)展。"
"這一項(xiàng)目補(bǔ)充了英國(guó)生物樣本庫(kù)制藥蛋白組學(xué)項(xiàng)目的工作,在原先項(xiàng)目基礎(chǔ)上提供了額外的蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)數(shù)據(jù)。我很期待看到全球科學(xué)界如何利用這些不同來(lái)源的數(shù)據(jù),在預(yù)防和治療多種疾病的新方法開發(fā)中取得突破性進(jìn)展。"
"蛋白質(zhì)組學(xué)正在進(jìn)入一個(gè)變革的時(shí)代,迄今為止,其在人類健康領(lǐng)域的影響受到傳統(tǒng)技術(shù)的限制," Standard BioTools, Inc.首席執(zhí)行官M(fèi)ichael Egholm博士表示,"今天標(biāo)志著一個(gè)重要的里程碑,因?yàn)槲覀儗㈩I(lǐng)先的、具備多種能力的由DNA驅(qū)動(dòng)的SOMAmer技術(shù)與領(lǐng)先的NGS平臺(tái)無(wú)縫集成,進(jìn)一步釋放英國(guó)生物樣本庫(kù)的潛力以加速人類健康的發(fā)展。"
檢測(cè)方法通過(guò)11K SOMAmer(慢解離速率修飾適配體)試劑檢測(cè)9,000種獨(dú)特的人類蛋白質(zhì),實(shí)現(xiàn)從樣本到分析的蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)研究。這一解決方案已在早期試用中為客戶所用,能夠檢測(cè)6,000種人類蛋白質(zhì),并與NovaSeq X、NovaSeq X Plus以及NovaSeq 6000測(cè)序儀兼容,從而在單一平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)多組學(xué)研究。該解決方案計(jì)劃于2025年上半年正式推出。
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