小熊貓生物發(fā)布蛋白質(zhì)工程云服務(wù),幫助產(chǎn)品落地進(jìn)入快車道
小熊貓生物于近日發(fā)布全新的蛋白質(zhì)工程云端實(shí)驗(yàn)服務(wù),這項(xiàng)服務(wù)也將成為其正在建立的「生物編程技術(shù)平臺(tái)」中的重要部分,推動(dòng)生物科技行業(yè)技術(shù)發(fā)展。蛋白質(zhì)工程云服務(wù),整合了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與設(shè)計(jì)、超高通量實(shí)驗(yàn)測(cè)試、自動(dòng)化機(jī)器學(xué)習(xí)、專有的蛋白表達(dá)系統(tǒng)和蛋白生產(chǎn)純化工藝等多種能力,可以讓蛋白質(zhì)產(chǎn)品的開發(fā)者,足不出戶,進(jìn)行新型蛋白質(zhì)開發(fā)、性能優(yōu)化到規(guī)模化生產(chǎn)的全流程。
蛋白質(zhì)是生命系統(tǒng)中實(shí)現(xiàn)功能的主要承擔(dān)者。這里面有提供力學(xué)結(jié)構(gòu)支撐的膠原蛋白,能夠完成特異性相互識(shí)別的抗原抗體,賦予神經(jīng)元火花的離子通道,催化各種復(fù)雜生化反應(yīng)的生物酶系統(tǒng)……人類對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行工程改造和生產(chǎn)的能力,正在重塑我們生活的世界,已經(jīng)在醫(yī)藥、食品、消費(fèi)品、農(nóng)業(yè)等多個(gè)領(lǐng)域改變了人們的日常生活。定制的重組抗體被廣泛地應(yīng)用在檢測(cè)試劑盒中,添加多種酶制劑的洗衣粉在幫助家家戶戶處理難除污漬,植物源的血紅蛋白可以為各類豆制品提供風(fēng)味、做成植物肉,各種生物催化劑也已經(jīng)在化工廠中逐步替代高污染的傳統(tǒng)方案。
我們相信,還有大量尚未被解決的應(yīng)用問(wèn)題,能夠利用蛋白質(zhì)給出低碳、高效的生物學(xué)方案。然而,開發(fā)蛋白質(zhì)產(chǎn)品目前仍然是一個(gè)復(fù)雜且耗時(shí)的過(guò)程。從發(fā)現(xiàn)、設(shè)計(jì)新的蛋白質(zhì),功能測(cè)試和性能優(yōu)化,一直到工業(yè)化生產(chǎn),都存在一定的技術(shù)挑戰(zhàn)。這些挑戰(zhàn)往往是復(fù)雜耦合的,高度依賴經(jīng)驗(yàn)和資本投入,存在研發(fā)周期久、規(guī)模化困難、失敗率高等諸多問(wèn)題。
為解決這一困境,小熊貓生物推出“端到端”的蛋白質(zhì)工程云服務(wù)。這樣,針對(duì)用戶的終端需求,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、機(jī)器學(xué)習(xí)指導(dǎo)的序列設(shè)計(jì)、生產(chǎn)菌株開發(fā)、規(guī)模化量產(chǎn)等多個(gè)技術(shù)模塊可以實(shí)現(xiàn)全局最優(yōu)化,為蛋白產(chǎn)品從概念到市場(chǎng)驗(yàn)證提供一條快車道。
具體服務(wù)模塊包括:
AI輔助蛋白質(zhì)發(fā)現(xiàn)和設(shè)計(jì):
? 利用實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)標(biāo)記和深度學(xué)習(xí)算法構(gòu)建的蛋白功能數(shù)據(jù)庫(kù),發(fā)現(xiàn)新蛋白和潛在的功能蛋白
? 使用Ailurus Fold,利用深度學(xué)習(xí)算法對(duì)目標(biāo)蛋白的結(jié)構(gòu)、功能和穩(wěn)定性進(jìn)行高通量預(yù)測(cè)以及序列優(yōu)化
基于超高通量測(cè)試和海量元件,進(jìn)行數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)型研發(fā):
? 20,000+種工程底盤、1000+億種Ailurus vec??表達(dá)載體,超高通量隨機(jī)篩選,刻畫蛋白質(zhì)表達(dá)特性
? 使用1200+種連接linker,連接19000+種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域,組裝海量融合蛋白,深入挖掘新功能
? 超高通量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),搭配自動(dòng)化機(jī)器學(xué)習(xí)和預(yù)訓(xùn)練模型,快速定制“序列-功能”優(yōu)化算法
大規(guī)模蛋白質(zhì)生產(chǎn)制備:
? 使用小熊貓人工菌種底盤,包涵體、二硫鍵等問(wèn)題的解決「插件」即插即用
? 數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的放大生產(chǎn)工藝,靈活支持從1 mL到100 L的生產(chǎn)規(guī)模
? 采用PandaPure??純化工藝,一步到位生產(chǎn)無(wú)標(biāo)簽蛋白
小熊貓生物將為醫(yī)藥、消費(fèi)品、環(huán)境、人工智能等多個(gè)領(lǐng)域的合作伙伴提供蛋白質(zhì)工程云服務(wù),支持全新產(chǎn)品和業(yè)務(wù)管線的研發(fā),讓消費(fèi)品市場(chǎng)用上安全易得的甜味劑,讓抗生素能以每年一代的速度更新,讓重組蛋白質(zhì)藥物能快速跨過(guò)臨床前研究,讓新的可降解材料能夠擁有多樣的顏色和性能。我們將在項(xiàng)目的第一階段,為用戶提供詳盡的科學(xué)研究報(bào)告或產(chǎn)研報(bào)告;并在第二階段,為經(jīng)濟(jì)上可行的蛋白質(zhì)產(chǎn)品提供相應(yīng)的生產(chǎn)產(chǎn)能。
在小熊貓生物,我們一直致力于不斷開發(fā)、改進(jìn)我們的平臺(tái),讓生物編程能夠像電子計(jì)算機(jī)編程一樣簡(jiǎn)單、高效,讓生物科技領(lǐng)域能像今天的IT工業(yè)一樣高速增長(zhǎng)。基于國(guó)際領(lǐng)先的生物編程、自動(dòng)化、計(jì)算生物學(xué)和蛋白生產(chǎn)能力,我們期待能與合作伙伴們,全面加速以蛋白質(zhì)為核心的各類產(chǎn)品的開發(fā)和落地。
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